BSA-seq+Target-seq快速精细定位
概要介绍:
BSA(Bulked Segregant Analysis):是一种利用极端性状进行功能基因定位的一种方法。主要是将两组具有极端性状的群体进行混池测序,比较两组群体在多态位点(SNP)的等位基因频率(AF)是否具有显著差异,即而将目标性状基因定位在染色体区段上。
基因组重测序
概要介绍:
全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的全基因组shotgun测序,并在此基础上对个体或群体进行变异检测。全基因组重测序的个体,通过序列比对,可以找到几乎全部的SNP和InDel,从而获得生物群体的遗传特征,推动在群体水平上进行物种的起源进化、环境适应性、自然选择和人工选择等方面的研究。并且利用全基因组重测序发现的大量变异进行全基因组关联分析有助于快速发现与动植物重要性状相关的遗传变异,发掘优良基因缩短分子育种周期。
简化基因组测序(GBS)
概要介绍:
简化基因组测序是利用限制性内切酶消化基因组DNA,再选择目标大小的酶切片段通过高通量测序的技术,可以用来检测酶切位点附近成干上万的SNP和InDel标记。简化基因组测序可以在极短的时间内以较低的成本开发出成千上万的标记,所以简化基因组测序是开展遗传连锁作图、群体遗传特征解析、群体结构分析、关联分析等研究的一种热门技术。