BSA-seq+Target-seq快速精细定位

概要简述:

BSA(Bulked Segregant Analysis):是一种利用极端性状进行功能基因定位的一种方法。主要是将两组具有极端性状的群体进行混池测序,比较两组群体在多态位点(SNP)的等位基因频率(AF)是否具有显著差异,即而将目标性状基因定位在染色体区段上。
BSA-seq+Target-seq快速精细定位

关键词: BSA-seq+Target-seq快速精细定位BSA-Seq+Target-Seq快速精细定位snp精细

详细介绍:

  BSA(Bulked Segregant Analysis):是一种利用极端性状进行功能基因定位的一种方法。主要是将两组具有极端性状的群体进行混池测序,比较两组群体在多态位点(SNP)的等位基因频率(AF)是否具有显著差异,即而将目标性状基因定位在染色体区段上。

  通过BSA-seq可以快速进行初定位,但这个区间通常比较大,还需要在区间内开发大量的INDEL、SSR或SNP标记进行精细定位。Target-seq快速精细定位即在BSA-seq获得的目标区间内设计数十个SNP标记(每间隔30-100kb设计一个SNP标记),利用多重PCR在大群体中扩增SNP标记并测序,一次性高效率、低成本完成大群体中的SNP基因型分析,筛选交换单株,在两个月内完成精细定位,实现精细定位一站式服务。

 

  产品优势

BSA-seq+Target-seq快速精细定位

 

 

  应用案例

产品

Zhao Bo et al.Theor.Appl.Genet.2018

 

  一个油菜矮杆基因的定位与克隆:BSA-Seq对DS-4进行初步定位,再通过Target-seq技术,使用F2和BC2F2群体,对DS-4进行精细定位。

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