环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类广泛存在于真核生物细胞中的闭合、环状的特殊lncRNA,其独特的环状结构使circRNA对RNase不敏感,具有很强的胞内稳定性。研究显示circRNA在生物的生长发育过程中起着很多重要的调控功能。通过对circRNA进行高通量测序能够获得其表达量、功能注释、分布统计、保守性以及与其他small RNA相互作用等许多内容,为研究者进一步研究circRNA的功能与调控机制提供重要的技术支持。
技术路线
技术参数
服务名称 |
测序策略 |
推荐数据量 |
测序周期 |
CircRNA测序 |
HiSeq PE150 |
10-15Gb clean data |
60个工作日 |
样品要求
1. 总RNA量 ≥ 10µg,浓度 ≥ 100ng/μL。
2. OD260/OD280在1.8-2.0之间,RNA无降解、28S和18S核糖体RNA条带非常亮且清晰(其大小决定于用于抽提RNA的物种类型),28S的密度大约是18S的2倍;Aglient 2100检测仪分析RNA完整性数据RIN ≥ 8。
3. 无蛋白质、基因组DNA污染,如有污染请去蛋白并进行DNase I处理。