转录组研究是研究生物体机体功能的一个重要手段。由于读长限制,目前二代测序技术无法直接获得单个转录本全长序列。基于PacBio超读长的单分子实时测序技术,能够直接读取反转录后的全长cDNA序列,从而获得高质量的全长转录组序列。
该技术能够准确辨别同源异构体、同源基因、等位基因等的转录本,鉴定异构体并对可变剪接、融合基因等进行精确分析,因此可用于分析多倍体物种、超大基因组物种及非模式物种等转录组。
技术路线
技术参数
服务名称 |
测序策略 |
推荐数据量 |
测序周期 |
全长转录组测序 |
PacBio SRII/Sequel |
4-8Gb |
40个工作日 |
样品要求
1. 总RNA量 ≥ 10µg,浓度 ≥100ng/μL。
2. OD260/OD280在1.8-2.0之间,RNA无降解、28S和18S核糖体RNA条带非常亮且清晰(其大小决定于用于抽提RNA的物种类型),28S的密度大约是18S的2倍;Aglient 2100检测仪分析RNA完整性数据RIN ≥ 8。无蛋白质、基因组DNA污染,如有污染请去蛋白并进行DNase I处理。