由于原核生物的mRNA没有polyA尾巴结构，需要先去除rRNA获得mRNA，再结合新一代高通量测序技术获得原核生物在特定环境条件下的几乎所有转录本。通过生物信息分析，可以获得该原核生物基因表达差异信息、SNP分析、预测新转录本等信息，这为研究原核生物基因的结构和基因的表达调控提供了一个重要的手段。

构建链特异性文库，经过测序后的数据分析可以确定转录本来自于正义链还是反义链。与普通文库相比，能够更准确的统计转录本的数量，确定基因结构，同时还可以挖掘新的ncRNA与反义转录本，为基因表达分析提供了有力的支持。

 

技术路线

 

技术参数

服务名称	测序策略	推荐数据量	测序周期
原核转录组测序	HiSeq PE150	10X	40个工作日

 

样品要求

1. 总RNA量 ≥ 3µg，浓度 ≥ 100ng/μL。

2. OD260/OD280在1.8-2.0之间，RNA无降解、23S和16S核糖体RNA条带非常亮且清晰（其大小决定于用于抽提RNA的物种类型），23S的密度大约是16S的2倍；Aglient 2100检测仪分析RNA完整性数据RIN ≥ 6.5；无蛋白质、基因组DNA污染，如有污染请去蛋白并进行DNase I处理。